《三国群英传》三代有新增了不少东西，首先，旧玩家一定会发现到的就是内政方式变的不一样了，之前的内政方式都是以部下人数来决定工作量，人越多就可以做更多事，而新的回合制则是依照君主的势力大小而有不同的下指令数目，表面上虽然指令数减少，但是原本只能每年做一次内政事务，现在则改为每个月都可以下指令，因此会有更充裕时间来统一全中国，发动战争也将并入到内政模式中，可以让玩家考虑的更清楚，不会有多线作战的烦恼。

新版特色

1、新增了40个自设武将头像，男性武将20名，女性武将20名

2、变更自设武将的能力属性，使武将技、军师技的分配自由度变大

3、新增“难度”选项

4、增加五种游戏字型

5、在黄巾贼、猛兽特殊事件可选择出阵武将

6、新增加特殊宝物

7、加入秘技功能，如无限指令、无限金钱、无限功勋值

武将系统

文武系统

在三国时代以太守为主的军事体系中无论是文官或武将都非常重要，三代中将出场的文武官总数增加至四百多人，并让双方的能力更趋于平衡，而不至于让玩家觉得武将的用处大于文官，游戏中的内政模式便是专门为文官所设计的，并让其加强在战争中的带兵及指挥能力，使军师更能一展长才，而不会有一面倒认为文官不好用的情形出现。

技能分配

《三国群英传3》延续了二代的武将在征战过程中逐渐升级的设定，但这次玩家却可任意为心爱的将士依自己的需要分配各种不同技能、自由培养手下的武将，较为不同的地方则是武将技与军师技并不是随着部属升级而直接获取，乃需要用战争中得到的功勋值换得。三代同时也恢复了一代才有的将军官位，用以代表可带兵数量的多寡，越高阶的将军可带的兵的数量越多，但也需要相应等级的武将方可担任。